Фильм знакомит зрителя с важными, но пока неразрешенными проблемами Русской Православной Церкви. Что такое сегодняшняя Церковь и где в Ней место Богу?
Как быть человеку, когда он перестает развиваться внутри Церкви и не получает ответов на свои вопросы? Как быть, когда уже недостаточно набора правил, канонов, и хочется чего-то большего? 

В фильме «Несвятая Святая» эти вопросы задаёт молодой человек трем мудрым отцам, глубокое миропонимание которых основано на любви к Богу и к ближнему, на ценности человеческой жизни и свободы.